More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3138 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  100 
 
 		 332 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  50.61 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  50.17 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  46.22 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  48.4 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  48.4 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.81 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  48.25 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  48.3 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  48.18 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  48.69 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  50.65 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  50.18 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  45.35 
 
 		 351 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  41.16 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  40.43 
 
 		 347 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.06 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  45.8 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  44.2 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  48.19 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.87 
 
 		 374 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  45.65 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  47.08 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  46.28 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  43.12 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  51.23 
 
 		 332 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  39.14 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  45.95 
 
 		 354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  45.74 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  43.81 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  42.72 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.69 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  39.41 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  45.04 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  39.41 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  43.65 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  40.71 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  43.98 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  39.33 
 
 		 348 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.19 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  44.88 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.33 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.33 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.33 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.33 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  40.34 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  41.97 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  44.04 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.28 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  37.29 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.65 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  44.88 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  44.55 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.88 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  44.88 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.88 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  38.13 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  45.34 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.88 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.55 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  42.62 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  41.39 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.55 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.55 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  42.05 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.36 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.34 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  36.12 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  35.84 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  35.84 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  35.48 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  35.48 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  38 
 
 		 351 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0306  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 		 350 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  34.9 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  44.57 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  42.23 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  45.68 
 
 		 341 aa  179  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  43.99 
 
 		 362 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  45.9 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  45.04 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  45.57 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  33.33 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  33.33 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  39.7 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  37.42 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  38.73 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  45.54 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.32 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  36.86 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.97 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  40.18 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  39.52 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  39.52 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  33.53 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>