More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7290 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  100 
 
 		 342 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  51.99 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  48.89 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  46.67 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  46.67 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  47.4 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.52 
 
 		 334 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  45.52 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  45.52 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  45.52 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  45.17 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  45.17 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  43.99 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  45.06 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  49.35 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  44.1 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  44.2 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  44.48 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  44.44 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  44.06 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  43.03 
 
 		 350 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  44.14 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  52.12 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  43.09 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.94 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  40.19 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  42.76 
 
 		 347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  40.19 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  40.19 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 351 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 351 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 351 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  42.14 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  43.03 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  38.92 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  41.64 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  38.94 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  39.25 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  40.99 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.98 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  41.61 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  42.99 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.79 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  46.69 
 
 		 363 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  39.18 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  41.1 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  42.72 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  39.88 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  38.32 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  38.32 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  38.51 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  42.61 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  41.83 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  44.94 
 
 		 364 aa  205  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  39.25 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  38.01 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  39.25 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.41 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  46.03 
 
 		 354 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  40.51 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  44.37 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  43.42 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  40.2 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  39.24 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  44.52 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.02 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  42.63 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  38.71 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  42.9 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  38.98 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  38.98 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0450  iron compound ABC transporter, permease protein  40.79 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  41.2 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.51 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4921  iron compound ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.406159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0397  iron compound ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  40.18 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  40.18 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  40.18 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  36.94 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  36.94 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  40.18 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  40.49 
 
 		 351 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  38.96 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1812  transport system permease protein  43.69 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.685396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  39.88 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  39.58 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  40.63 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>