More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 346 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.8 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  55.08 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  54.46 
 
 		 354 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  50.16 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  55.26 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  52.98 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  52.67 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  48.83 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  53 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  47.93 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3070  iron-enterobactin transporter membrane protein  56.58 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  55.48 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  44.62 
 
 		 344 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  56.19 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  55.78 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  49.42 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  48.34 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  50.47 
 
 		 347 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  49.23 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  48.55 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  51.15 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  44.92 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  47.37 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  51.39 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  46.1 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  47.73 
 
 		 336 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  47.25 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  48.51 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2929  transport system permease protein  56.25 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  50 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  45.21 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  45.82 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  50.16 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  43.83 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.86 
 
 		 357 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.53 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  44.41 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  51.82 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  51.13 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.4 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.56 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  49.18 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  47.88 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  47.88 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.88 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.88 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  41.56 
 
 		 335 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.88 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  47.56 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.56 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.56 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.56 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  45.18 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.89 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.89 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.89 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.56 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.89 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1492  putative ferrichrome transport system permease protein  55.7 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  49.03 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  43.17 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0139  iron-siderophore ABC transporter, membrane permease component  41.4 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  44.8 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  42.72 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.46 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.67 
 
 		 335 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  38.56 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  38.56 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  42.95 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2541  transport system permease protein  47.77 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.223195  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  46.38 
 
 		 392 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  46.2 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2442  ferric enterobactin ABC transporter, permease protein FepD  47.3 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  46.36 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3184  ferric enterobactin ABC transporter permease FepD  47.77 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  51.55 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  40.79 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  50.32 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  41.93 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  39.64 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  38.01 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  46.6 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.14 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  37.37 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.71 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.13 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.13 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  47.95 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  37.71 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  37.71 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  37.71 
 
 		 340 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>