More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1450 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  100 
 
 
332 aa  611  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  70.52 
 
 
354 aa  334  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.49 
 
 
351 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  52.15 
 
 
366 aa  267  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  55.56 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  46.39 
 
 
335 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  48.2 
 
 
341 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  50.16 
 
 
334 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  50.6 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  45.42 
 
 
347 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.69 
 
 
374 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  45.37 
 
 
347 aa  245  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  50.16 
 
 
350 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  53.4 
 
 
353 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  49.51 
 
 
347 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  50.16 
 
 
363 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
334 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.84 
 
 
368 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  38.48 
 
 
340 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
334 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  38.79 
 
 
340 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  38.48 
 
 
334 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  46.82 
 
 
344 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  50 
 
 
352 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  52.1 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  48.39 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  48.49 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  52.1 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  46.6 
 
 
347 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.74 
 
 
329 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  53.42 
 
 
332 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  39.51 
 
 
334 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
334 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
334 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  43.87 
 
 
335 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  43.98 
 
 
351 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
334 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  41.87 
 
 
333 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  48.09 
 
 
344 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0306  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  47.8 
 
 
350 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  52.75 
 
 
344 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.04 
 
 
358 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  50.33 
 
 
366 aa  222  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  50.65 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  38.65 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  45.51 
 
 
342 aa  219  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  47.23 
 
 
333 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  51.35 
 
 
360 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  44.34 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  39.94 
 
 
329 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  45.98 
 
 
336 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.18 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  41.43 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  43.94 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  41.27 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  38.36 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  38.36 
 
 
322 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  47.72 
 
 
362 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  42.09 
 
 
332 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  39.74 
 
 
342 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.67 
 
 
338 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  42.35 
 
 
344 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1630  transport system permease protein  49.68 
 
 
356 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  44.27 
 
 
364 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  49.36 
 
 
354 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  51.54 
 
 
352 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3070  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.22 
 
 
341 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1805  transport system permease protein  50.32 
 
 
334 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  41.5 
 
 
340 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.8 
 
 
357 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  49.29 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  38.58 
 
 
340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  48.96 
 
 
349 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  49.1 
 
 
341 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  47.6 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  49.64 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.03 
 
 
346 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.72 
 
 
335 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
335 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
335 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
335 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
335 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10160  ferric enterobactin transport protein FepD  49.18 
 
 
340 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0016497  normal  0.782861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  46.24 
 
 
347 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  46.71 
 
 
332 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  48.51 
 
 
346 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.09 
 
 
337 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  38.49 
 
 
329 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  38.82 
 
 
335 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  44.44 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  43.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  43.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 
334 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  42.72 
 
 
334 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.72 
 
 
334 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.72 
 
 
334 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>