More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4040 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  100 
 
 		 344 aa  660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  49.41 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  48.55 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  51.97 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  56.94 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.71 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  47.75 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  48.08 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  46.81 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  46.83 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  44.11 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  46.98 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  43.17 
 
 		 347 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  44.44 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  48.71 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  48.47 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  44.55 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  45.64 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  43.93 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  51.01 
 
 		 332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  44.3 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.52 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  42.86 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  48.4 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  47.31 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  40.47 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  44.61 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  41.09 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  47.32 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  39.36 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  41.72 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  41.72 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  39.26 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  47.27 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.91 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.15 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  47.33 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.21 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  44.84 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  46.01 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  40.43 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  43.77 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.6 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  46.05 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  40.92 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  46.69 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  46.82 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  38.87 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.16 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  44.21 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  42.61 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  43.11 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  40.15 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  40 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  40 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  40 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  40.49 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  43.93 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  46.74 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  39.64 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  40.8 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  43.14 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.67 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.33 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  36.7 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  40.59 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  39.64 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  38.93 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.49 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  43.42 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  45.65 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  45.65 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  36.36 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  35.9 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.18 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  42.67 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  38.3 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  38.08 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  38.16 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  46.21 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 334 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  37.84 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>