More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2415 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  100 
 
 
333 aa  627  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  58.19 
 
 
325 aa  319  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  46.34 
 
 
349 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 
351 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  43.91 
 
 
351 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  43.91 
 
 
351 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  43.91 
 
 
351 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  43.59 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  42.95 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  43.54 
 
 
332 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
343 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  42.86 
 
 
350 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  42.38 
 
 
326 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  41.51 
 
 
322 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  41.51 
 
 
322 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  42.81 
 
 
344 aa  225  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  45.61 
 
 
333 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
344 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
344 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
344 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  41.85 
 
 
344 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  41.85 
 
 
344 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  41.85 
 
 
344 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  43.92 
 
 
333 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  42.68 
 
 
347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  41.85 
 
 
344 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  41.89 
 
 
340 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  41.89 
 
 
340 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  41.89 
 
 
334 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
334 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
334 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  41.21 
 
 
344 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  41.55 
 
 
340 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  41.64 
 
 
336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  41.74 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  37.01 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  40.3 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 
334 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  36.01 
 
 
335 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  40.2 
 
 
334 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  36.01 
 
 
335 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
335 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
335 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
298 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  41.91 
 
 
337 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 
334 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
335 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  41.91 
 
 
337 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.59 
 
 
329 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  37.69 
 
 
336 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.2 
 
 
337 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  35.37 
 
 
335 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  35.37 
 
 
335 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.56 
 
 
345 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  38.84 
 
 
376 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  38.3 
 
 
338 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  40.72 
 
 
344 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  38.94 
 
 
338 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  38.94 
 
 
338 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  48.36 
 
 
335 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
342 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
346 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  35.69 
 
 
335 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0397  iron compound ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  42.6 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4921  iron compound ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 
346 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.406159  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0382  iron compound ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  34.04 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  38.63 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  43.42 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  34.04 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  42.75 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0450  iron compound ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
346 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  38.24 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  38.24 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  40.73 
 
 
334 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  38.24 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  38.24 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
338 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0322  ferrichrome transport system permease  38.63 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  41.03 
 
 
329 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  36.56 
 
 
337 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1812  transport system permease protein  47.06 
 
 
350 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.685396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.48 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2443  transport system permease protein  39.09 
 
 
374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  36.25 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  38.27 
 
 
340 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  41.99 
 
 
340 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.72 
 
 
374 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>