More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1623 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  100 
 
 
354 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  58.65 
 
 
351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  58.82 
 
 
353 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.13 
 
 
374 aa  297  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  51.13 
 
 
334 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  49.7 
 
 
350 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  58.25 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  51.15 
 
 
341 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  53.97 
 
 
366 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  55.66 
 
 
354 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  56.07 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  54.75 
 
 
333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  47.69 
 
 
347 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  55.81 
 
 
363 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  53.24 
 
 
352 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  51.71 
 
 
362 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.58 
 
 
368 aa  262  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  50 
 
 
344 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  54.37 
 
 
352 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  44.29 
 
 
351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  50.97 
 
 
363 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  46.13 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  49.37 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  46.5 
 
 
347 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  53.07 
 
 
344 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.67 
 
 
357 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  51.06 
 
 
366 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  47.85 
 
 
351 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  51.63 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  47.31 
 
 
344 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  48.51 
 
 
342 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.44 
 
 
322 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.44 
 
 
322 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.37 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  51.6 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  50.6 
 
 
332 aa  232  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.15 
 
 
346 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  43.6 
 
 
332 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  39.61 
 
 
333 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  42.3 
 
 
347 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  42.3 
 
 
337 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.06 
 
 
338 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  46.75 
 
 
347 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  48.1 
 
 
364 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  42.68 
 
 
335 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  46.77 
 
 
344 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  47.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  41.99 
 
 
340 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  42.63 
 
 
348 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  43.18 
 
 
350 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  47.88 
 
 
335 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  40.79 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  47.25 
 
 
336 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  48.54 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  48.54 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.54 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.54 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.54 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  36.81 
 
 
340 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.81 
 
 
340 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  36.48 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  36.48 
 
 
334 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.22 
 
 
334 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.22 
 
 
334 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  48.22 
 
 
334 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  48.22 
 
 
334 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  42.81 
 
 
340 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.92 
 
 
335 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  39.8 
 
 
333 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  40.39 
 
 
342 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.28 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  42.49 
 
 
329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.97 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  43.11 
 
 
347 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  42.9 
 
 
329 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  44.08 
 
 
343 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  48.2 
 
 
335 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
334 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
334 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  49.3 
 
 
349 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
334 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  44.44 
 
 
392 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  46.06 
 
 
354 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  40.67 
 
 
340 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  47.62 
 
 
341 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.13 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3415  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.42 
 
 
334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.533085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  37.01 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  37.01 
 
 
351 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  43.43 
 
 
346 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>