More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3528 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  100 
 
 
336 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  47.73 
 
 
334 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  45.6 
 
 
347 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  46.54 
 
 
350 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  49.4 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.63 
 
 
351 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  52.75 
 
 
354 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  46.82 
 
 
344 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  47.71 
 
 
366 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  45.1 
 
 
358 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  42.22 
 
 
347 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  48.95 
 
 
351 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  44.55 
 
 
341 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  49.35 
 
 
363 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  47.87 
 
 
363 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  47.8 
 
 
353 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  51.05 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  45.92 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  42.81 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  44.11 
 
 
347 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.05 
 
 
374 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  42.55 
 
 
332 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  41.8 
 
 
350 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  44.55 
 
 
347 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  48.05 
 
 
344 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  50.99 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  45.1 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.7 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  41.39 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  39.61 
 
 
333 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  43.93 
 
 
344 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  42.34 
 
 
351 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  40.85 
 
 
322 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  43.64 
 
 
357 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  40.85 
 
 
322 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  41.12 
 
 
335 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  42.02 
 
 
333 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.79 
 
 
368 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  46.89 
 
 
333 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.78 
 
 
338 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  38.34 
 
 
336 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  41.42 
 
 
340 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  43.14 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  44.92 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.71 
 
 
355 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  42.62 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  46.75 
 
 
366 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
334 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  47.42 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.68 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  45.02 
 
 
347 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  36.17 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  36.47 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  36.17 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0306  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 
350 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  45.65 
 
 
360 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  46.83 
 
 
366 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
334 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2818  transport system permease protein  44.61 
 
 
344 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  37.66 
 
 
334 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
334 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  45.1 
 
 
334 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
334 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.1 
 
 
334 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.1 
 
 
334 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  45.1 
 
 
334 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.1 
 
 
334 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.77 
 
 
334 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.77 
 
 
334 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.77 
 
 
334 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  44.77 
 
 
334 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  41.67 
 
 
326 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3070  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.02 
 
 
341 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.251798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  39.82 
 
 
340 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  46.79 
 
 
332 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22080  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.74 
 
 
335 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  37.12 
 
 
329 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  45.78 
 
 
335 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.62 
 
 
335 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.62 
 
 
335 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  42.12 
 
 
336 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 
366 aa  186  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.62 
 
 
335 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.62 
 
 
335 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  42.62 
 
 
335 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  45.98 
 
 
332 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  41.1 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  38.65 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.3 
 
 
332 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  34.95 
 
 
343 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  34.95 
 
 
343 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  41.97 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  38.08 
 
 
340 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  36.34 
 
 
335 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
335 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  45.42 
 
 
335 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  38.92 
 
 
351 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>