More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1524 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  100 
 
 		 329 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  93.01 
 
 		 329 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  57.94 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  58.9 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  59.38 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  53.23 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  51.96 
 
 		 333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  48.25 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 		 334 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  48.25 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  47.94 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  48.25 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  47.94 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  48.73 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  48.89 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  47.27 
 
 		 347 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  47.15 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  46.84 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  54.69 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  45.62 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  43.75 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  43.75 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  48.38 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  46.13 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  44.05 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  49.67 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.76 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  44.41 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  40 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  40 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  41.74 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 351 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  45.42 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  39.69 
 
 		 351 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  40.31 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  43.89 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  42.67 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  42.33 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  45.02 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  37.74 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  44.22 
 
 		 363 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  37.42 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  38.56 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  38.56 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  43.69 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  37.42 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  43.85 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  37.42 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  42 
 
 		 353 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  40.2 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  37.74 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  42.09 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.55 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  43.22 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  40.66 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  35.22 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  40.32 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  40.71 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  41.61 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  41.32 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  37.93 
 
 		 351 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  38.69 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.67 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  42.37 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.38 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  45.12 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  43.42 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  42.11 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  40.5 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  42.02 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  39.33 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  41.88 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  36.34 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  37.11 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  37.11 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  38.61 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  37.11 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  37.58 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  37.58 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  39.13 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.08 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  40.19 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>