More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0414 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  100 
 
 		 335 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  61.71 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  60.99 
 
 		 340 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  55.87 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  55.87 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  69.16 
 
 		 343 aa  348  7e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 		 334 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  49.7 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  49.39 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  49.39 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  49.39 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  54.72 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  54.46 
 
 		 333 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 		 334 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  49.09 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  49.7 
 
 		 334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  49.09 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  46.89 
 
 		 336 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  56.01 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  55.74 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  53.77 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  52.12 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  49.7 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  48.15 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  49.52 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  47.65 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  49.23 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  50.15 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  53.95 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  48.36 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.9 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  46.82 
 
 		 344 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  46.93 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  44.3 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  44.3 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  43.99 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  43.99 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  43.99 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  51.07 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.34 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  43.35 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  52.22 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  42.06 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.14 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  41.43 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  50 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  48.83 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  53.02 
 
 		 364 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  41.43 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  47.42 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  50.5 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  41.43 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  41.43 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  46.32 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  47.54 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  42.06 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  49.05 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  41.12 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  45.89 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.51 
 
 		 374 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  43.57 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  44.38 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  49.35 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  43.17 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  44.65 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  45.71 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  48.97 
 
 		 353 aa  235  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  43.61 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  41.51 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  45.4 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  45.71 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  45.71 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  45.71 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2318  transport system permease protein  51.67 
 
 		 347 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  46.2 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  44.38 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  47.73 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  49.51 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  41.82 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  44.07 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  50.94 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.29 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  49.83 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  49.17 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  46.39 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  50.17 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  47.74 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  49.65 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  38.22 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>