More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1776 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  100 
 
 
343 aa  675    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  72.59 
 
 
343 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  72.59 
 
 
343 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.54 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  41.29 
 
 
333 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  40.24 
 
 
329 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  41.14 
 
 
322 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  41.14 
 
 
322 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  36.56 
 
 
332 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  38.39 
 
 
333 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  36.93 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  41.07 
 
 
336 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  34.1 
 
 
349 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
334 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.75 
 
 
340 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
351 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  36.75 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  36.75 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  36.75 
 
 
340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  39.27 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
334 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.31 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
351 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
351 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  34.9 
 
 
334 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  34.9 
 
 
334 aa  212  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
334 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  35.06 
 
 
351 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  35.06 
 
 
351 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
351 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
334 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  35.06 
 
 
351 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  37.03 
 
 
347 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  40.79 
 
 
307 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  38.49 
 
 
340 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  34.3 
 
 
350 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 
344 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  39.34 
 
 
337 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  35.67 
 
 
344 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  34.06 
 
 
326 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  39.18 
 
 
340 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  35.97 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  36.03 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  34.88 
 
 
363 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  34.4 
 
 
347 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 
337 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  34.62 
 
 
344 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  37.83 
 
 
337 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  34.8 
 
 
344 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  34.8 
 
 
344 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  38.41 
 
 
331 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  38.41 
 
 
331 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  34.8 
 
 
344 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
344 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.13 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
342 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
342 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  35.65 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  36.24 
 
 
340 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
325 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  34.15 
 
 
347 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.44 
 
 
337 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
342 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
298 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  34.44 
 
 
337 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.44 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.44 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  38.64 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.44 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  35.55 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  32.94 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.33 
 
 
644 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1048  transport system permease protein  31.8 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  34.28 
 
 
333 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 
335 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  32.94 
 
 
335 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  34.75 
 
 
334 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  35 
 
 
335 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 
335 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  33.24 
 
 
335 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.44 
 
 
342 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.21 
 
 
351 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  33.99 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  33.33 
 
 
350 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  32.65 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  32.65 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  35 
 
 
324 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  30.82 
 
 
336 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>