117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8424 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 701 aa  1424    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  45.34 
 
 		 643 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  49.2 
 
 		 599 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  46.75 
 
 		 656 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  40.88 
 
 		 592 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  40.72 
 
 		 1098 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 1113 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 1100 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 1101 aa  340  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  49.32 
 
 		 578 aa  336  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 1094 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 1172 aa  332  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 1100 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 1112 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 1112 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 1111 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 1120 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 1138 aa  301  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35.32 
 
 		 1147 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  30.38 
 
 		 917 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  32.21 
 
 		 1132 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 1118 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  34.8 
 
 		 597 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  36.54 
 
 		 938 aa  147  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.23 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  26.24 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  21.18 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  21.18 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  21.34 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.57 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.18 
 
 		 861 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  21.68 
 
 		 861 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  20.88 
 
 		 861 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.72 
 
 		 859 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  22.5 
 
 		 858 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.51 
 
 		 859 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  21.61 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  26.52 
 
 		 854 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  30.17 
 
 		 484 aa  111  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.62 
 
 		 875 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  24.41 
 
 		 813 aa  107  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  25.32 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  25.32 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.51 
 
 		 883 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.41 
 
 		 870 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  26.55 
 
 		 872 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  24.35 
 
 		 839 aa  98.6  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  25.85 
 
 		 723 aa  98.6  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.27 
 
 		 863 aa  98.2  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.45 
 
 		 863 aa  97.4  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  24.64 
 
 		 854 aa  97.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.1 
 
 		 850 aa  94.4  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  28.27 
 
 		 867 aa  94.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.56 
 
 		 850 aa  94  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  30.72 
 
 		 869 aa  93.6  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  28.79 
 
 		 867 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  25.18 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  23.91 
 
 		 879 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  24.36 
 
 		 864 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  25 
 
 		 850 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  24.69 
 
 		 880 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  24.69 
 
 		 880 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.65 
 
 		 872 aa  88.2  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  21.1 
 
 		 861 aa  87.4  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.7 
 
 		 844 aa  87  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  24.42 
 
 		 880 aa  87  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  25.85 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  20.04 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  29.66 
 
 		 855 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  26.92 
 
 		 864 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  22.19 
 
 		 905 aa  84  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.97 
 
 		 875 aa  84  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  27.51 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  27.11 
 
 		 864 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  20.9 
 
 		 851 aa  80.9  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  22.79 
 
 		 395 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  26.84 
 
 		 864 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  25.72 
 
 		 880 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  24.5 
 
 		 880 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  27.3 
 
 		 889 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  27.3 
 
 		 889 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  25.72 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  27.3 
 
 		 889 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  18.43 
 
 		 851 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  22.88 
 
 		 871 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  24.68 
 
 		 346 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  27.6 
 
 		 864 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  25.19 
 
 		 896 aa  75.5  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  22.49 
 
 		 857 aa  75.5  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  27.11 
 
 		 844 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  25.18 
 
 		 880 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  27.11 
 
 		 844 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  18.33 
 
 		 851 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  24.24 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.88 
 
 		 864 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  23.01 
 
 		 844 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  22.7 
 
 		 871 aa  73.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  22.3 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>