117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11635 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  970    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  40.24 
 
 
597 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
1132 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 
1094 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  29.06 
 
 
643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  33.87 
 
 
599 aa  127  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  32.93 
 
 
578 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  29.33 
 
 
592 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  30.62 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  31.01 
 
 
1118 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  28.7 
 
 
1147 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
1120 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
1172 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 
1111 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  30.17 
 
 
701 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
1112 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
1112 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
1100 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  28.98 
 
 
1113 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 
1138 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  27.63 
 
 
938 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 
1100 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  28.94 
 
 
1098 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
1101 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  26.69 
 
 
917 aa  91.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  25.08 
 
 
839 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  27.81 
 
 
850 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  23.99 
 
 
852 aa  81.6  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  23.76 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  24.83 
 
 
863 aa  80.1  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.31 
 
 
883 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  26.15 
 
 
857 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  27.37 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  20.68 
 
 
556 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  23.89 
 
 
863 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  23.13 
 
 
854 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.84 
 
 
869 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  22.82 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  22.71 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  24.14 
 
 
877 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  20.06 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.91 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  20.06 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.91 
 
 
859 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  24.14 
 
 
877 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  20.96 
 
 
862 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.72 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  22.84 
 
 
905 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  23.96 
 
 
723 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  24.58 
 
 
872 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  21.91 
 
 
861 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  21.91 
 
 
861 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  20.72 
 
 
861 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.29 
 
 
858 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  20.65 
 
 
861 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  25.9 
 
 
896 aa  67.8  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  21.55 
 
 
861 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  21.55 
 
 
861 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  21.55 
 
 
861 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  21.55 
 
 
861 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.55 
 
 
861 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  22.11 
 
 
850 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  22.22 
 
 
850 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  22.98 
 
 
850 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  22.22 
 
 
850 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  22.98 
 
 
850 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  22.83 
 
 
866 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  23.44 
 
 
875 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  21.45 
 
 
850 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  22.56 
 
 
850 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  23.53 
 
 
840 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  23.53 
 
 
840 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  21.56 
 
 
870 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  23.03 
 
 
840 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  24.28 
 
 
877 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  22.64 
 
 
864 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  23.68 
 
 
850 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  20.54 
 
 
813 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  21.76 
 
 
881 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  26.19 
 
 
346 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  20.98 
 
 
875 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  22.79 
 
 
861 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  22.09 
 
 
867 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  22.15 
 
 
864 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  23.4 
 
 
844 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  22.77 
 
 
864 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  22.92 
 
 
854 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  21.17 
 
 
867 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  23.59 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  22.06 
 
 
889 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  22.06 
 
 
889 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  22.06 
 
 
889 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  18.68 
 
 
844 aa  54.7  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  21.02 
 
 
872 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  21.5 
 
 
557 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  17.56 
 
 
847 aa  54.3  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  22.35 
 
 
864 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  24.38 
 
 
880 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  24.38 
 
 
880 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  22.08 
 
 
877 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>