115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0206 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1173    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  48.23 
 
 
701 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  55.83 
 
 
643 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  52.03 
 
 
656 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  42.04 
 
 
592 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
1113 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  47.51 
 
 
1098 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
1094 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  42.52 
 
 
578 aa  339  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
1172 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
1100 aa  332  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
1101 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
1100 aa  326  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
1112 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
1112 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
1111 aa  316  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
1138 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
1120 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  36.89 
 
 
1147 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  35.39 
 
 
917 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
1118 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
1132 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  35.07 
 
 
597 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  32.05 
 
 
938 aa  160  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.04 
 
 
556 aa  156  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  28.52 
 
 
568 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.53 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.53 
 
 
556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  33.14 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  27.43 
 
 
857 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.31 
 
 
863 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  28.33 
 
 
839 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  23.04 
 
 
852 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  27.3 
 
 
854 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  27.61 
 
 
844 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  22.37 
 
 
813 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  26.49 
 
 
905 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  28.28 
 
 
877 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  28.28 
 
 
877 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  21.44 
 
 
851 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  27.53 
 
 
877 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.82 
 
 
863 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  21.44 
 
 
851 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.55 
 
 
859 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.55 
 
 
859 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.31 
 
 
861 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.24 
 
 
861 aa  100  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.24 
 
 
861 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.24 
 
 
861 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.24 
 
 
861 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.94 
 
 
861 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.24 
 
 
861 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  27.79 
 
 
850 aa  97.8  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.64 
 
 
861 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.08 
 
 
871 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  24.1 
 
 
723 aa  92  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  22.84 
 
 
858 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.92 
 
 
854 aa  91.3  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  25.69 
 
 
871 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.11 
 
 
851 aa  90.5  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  23.78 
 
 
569 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  26.94 
 
 
866 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  22.88 
 
 
861 aa  89  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  28.52 
 
 
883 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  23.05 
 
 
847 aa  88.6  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.15 
 
 
872 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  27.73 
 
 
850 aa  88.6  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  28.4 
 
 
879 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  23.78 
 
 
395 aa  88.2  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  27.43 
 
 
867 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.68 
 
 
861 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  20.1 
 
 
875 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  25.31 
 
 
346 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  27.36 
 
 
867 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  21.43 
 
 
850 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.79 
 
 
844 aa  85.1  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  25.78 
 
 
864 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.25 
 
 
850 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  28.7 
 
 
855 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  22.45 
 
 
862 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  21.08 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  21.43 
 
 
850 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  27.7 
 
 
896 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.93 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  27.33 
 
 
869 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  20.51 
 
 
850 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  28.04 
 
 
880 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.42 
 
 
875 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  21.9 
 
 
850 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  27.41 
 
 
880 aa  80.1  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  27.66 
 
 
880 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  21.81 
 
 
850 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  20.93 
 
 
840 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  26.87 
 
 
880 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.21 
 
 
877 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  28.27 
 
 
881 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  27.3 
 
 
876 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  21.57 
 
 
850 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  26.45 
 
 
870 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.21 
 
 
844 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>