143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1896 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  98.05 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  43.03 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  42.19 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  39.27 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  42.19 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  39.13 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  37.25 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  37.14 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  35.02 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  34.26 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  38 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0554  protein of unknown function DUF1212  35.51 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  33.73 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  35.65 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  35.34 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0609  hypothetical protein  30.33 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0623  hypothetical protein  30.33 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  26.67 
 
 		 410 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  30.08 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  26.51 
 
 		 467 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  24.68 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.4 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  28.11 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  28.11 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  28.11 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1824  phosphoglycerate kinase  27.43 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  24.68 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  24.9 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.9 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  27.71 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.13 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  29.15 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  25.3 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  23.11 
 
 		 529 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  26.48 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  23.73 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  23.81 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  27.02 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1616  hypothetical protein  23.89 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  23.81 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  22.87 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  23.77 
 
 		 466 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  27.02 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  26.21 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  22.71 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  22.71 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  23.08 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  22.71 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  23.95 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  22.27 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  24.69 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  24.69 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  23.31 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  25.82 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  24.2 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  23.53 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  25.1 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  22.95 
 
 		 555 aa  62  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1300  hypothetical protein  24.69 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0681274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  25.41 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1181  hypothetical protein  24.69 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  25.71 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  23.93 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  22.51 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.14 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  25.91 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  25.81 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  25.81 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  23.43 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  25.7 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  25.7 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  22.83 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  25.7 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  25.9 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  25.81 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  22.08 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  21.91 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  23.48 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  23.97 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  23.89 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  23.43 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  23.81 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1085  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF1212 domain protein)  24.48 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.451526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  23.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  23.73 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  24.19 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  23.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  23.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>