More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0540 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  97.83 
 
 		 461 aa  917    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 461 aa  936    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  35.73 
 
 		 447 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 		 462 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  32.61 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.07 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 487 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2983  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 467 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.08 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.61 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2855  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 483 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.24 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3996  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0734403  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.63 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 422 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 470 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.61 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  24.57 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 440 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.85 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.11 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.41 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.67 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.1 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.14 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 419 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  23.57 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.67 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.87 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2576  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.97 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>