More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00140 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  56.69 
 
 
627 aa  680    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  100 
 
 
635 aa  1309    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  51.96 
 
 
587 aa  629  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  51.96 
 
 
587 aa  629  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  48.94 
 
 
659 aa  567  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  42.63 
 
 
668 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  41.31 
 
 
561 aa  333  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  39.71 
 
 
478 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  39.26 
 
 
484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  35.62 
 
 
608 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  35.71 
 
 
464 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  33.92 
 
 
598 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  34.69 
 
 
597 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  34.57 
 
 
457 aa  241  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.9 
 
 
465 aa  230  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  33.9 
 
 
596 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  33.69 
 
 
598 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.69 
 
 
588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.87 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  33.26 
 
 
598 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.54 
 
 
589 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.19 
 
 
589 aa  213  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  31.45 
 
 
504 aa  213  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  32.88 
 
 
596 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.47 
 
 
957 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.9 
 
 
596 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.55 
 
 
596 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  32.68 
 
 
596 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  32.43 
 
 
597 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  32.68 
 
 
596 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  32.68 
 
 
596 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  32.68 
 
 
596 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  32.68 
 
 
596 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.05 
 
 
593 aa  203  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  31.64 
 
 
596 aa  201  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  32.3 
 
 
596 aa  201  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  33.78 
 
 
591 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.86 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.45 
 
 
589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  29.06 
 
 
925 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  29.84 
 
 
925 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.19 
 
 
596 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  32.29 
 
 
650 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.43 
 
 
584 aa  188  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  30.31 
 
 
583 aa  187  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.01 
 
 
926 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.56 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  30.27 
 
 
591 aa  184  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.4 
 
 
599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.33 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  30.2 
 
 
609 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  27.97 
 
 
637 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.47 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  29.34 
 
 
511 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  31.45 
 
 
631 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  30.19 
 
 
517 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  29.53 
 
 
582 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.15 
 
 
616 aa  166  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  30.94 
 
 
518 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  29.36 
 
 
510 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  28.04 
 
 
483 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.27 
 
 
582 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.79 
 
 
582 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.65 
 
 
519 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  26.77 
 
 
1005 aa  153  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  28.67 
 
 
582 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  28.67 
 
 
582 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  29.42 
 
 
517 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  30.61 
 
 
1004 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  30.62 
 
 
515 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.63 
 
 
519 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.05 
 
 
517 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.24 
 
 
519 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  28.36 
 
 
512 aa  150  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  29.39 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  29.74 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  27.62 
 
 
506 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.95 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  29.54 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  29.48 
 
 
521 aa  147  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  27.86 
 
 
506 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  26.95 
 
 
506 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.07 
 
 
603 aa  145  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.67 
 
 
616 aa  144  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  27.86 
 
 
506 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 
511 aa  143  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.06 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  28.57 
 
 
519 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  29.71 
 
 
576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  27.65 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  28.78 
 
 
500 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  26.05 
 
 
605 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  26.83 
 
 
576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  27.72 
 
 
606 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  26.67 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  29.02 
 
 
508 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0383  L-aspartate oxidase  29.06 
 
 
439 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  26.54 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.76 
 
 
540 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  28.02 
 
 
520 aa  134  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>