126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0928 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  55.56 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  48.75 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  47.89 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 116 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  42.42 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  36.36 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  36.62 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  58.82 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  36.67 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  47.06 
 
 		 517 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 513 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  51.11 
 
 		 516 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  48.72 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  35 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  36 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2226  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.782341  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  48.08 
 
 		 507 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 263 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 124 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  35.56 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>