More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2947 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 345 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  90.43 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  91.88 
 
 		 345 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  72.51 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  61.92 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  60.76 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  60.98 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  60.4 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  59.48 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  58.02 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  58.31 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  57.73 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  57.73 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  56.1 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  52.77 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  53.18 
 
 		 361 aa  358  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  54.52 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  56.56 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  55.1 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  51.31 
 
 		 341 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  52.34 
 
 		 343 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  53.87 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  53.35 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  53.06 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  50.73 
 
 		 341 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  51.02 
 
 		 342 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  50.86 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  49.28 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  47.97 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  46.8 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  48.14 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  47.28 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  47.38 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.73 
 
 		 354 aa  261  8.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  44.38 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  46.06 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  42.94 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  41.06 
 
 		 577 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  43.31 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  41.45 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  40.06 
 
 		 578 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  39.27 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 582 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  39.45 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 340 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  41.52 
 
 		 368 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  43.52 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  43.52 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  41.33 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  43.23 
 
 		 340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  41.04 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  42.07 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  40.75 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  41.74 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.94 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  38.66 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  39.69 
 
 		 340 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  43.67 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  33.94 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  40.62 
 
 		 341 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  41.62 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  41.62 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  41.45 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  33.98 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  45.15 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  41.16 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  39.88 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  42.29 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  43.42 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  42.61 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  44.92 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  32.38 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  41.99 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  36.11 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  42.54 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  31.68 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  38.99 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  37.55 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.53 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.7 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  39.51 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.09 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  32.38 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  36.82 
 
 		 438 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  47.78 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  36.56 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  37.84 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  36.65 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>