More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0069 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0040  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.17 
 
 
520 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.09 
 
 
538 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.831333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  82.3 
 
 
538 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0050  RND efflux system outer membrane lipoprotein  99.24 
 
 
523 aa  1024    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2773  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.09 
 
 
538 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0020  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  82.3 
 
 
538 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3948  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  73.44 
 
 
523 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.822582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.3 
 
 
538 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3232  RND efflux system outer membrane lipoprotein  95.03 
 
 
523 aa  868    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254242  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0049  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.51 
 
 
509 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963186  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.88 
 
 
539 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1878  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.09 
 
 
538 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  73.5 
 
 
523 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0069  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
523 aa  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  73.67 
 
 
536 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0051  RND efflux system outer membrane lipoprotein  92.53 
 
 
527 aa  794    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27692  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  99.24 
 
 
523 aa  1024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.25615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3506  RND efflux system outer membrane lipoprotein  82.09 
 
 
538 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  53.33 
 
 
508 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  54.18 
 
 
501 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  54.18 
 
 
501 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  51.98 
 
 
497 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  50.63 
 
 
498 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.87 
 
 
486 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  51.05 
 
 
499 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48 
 
 
487 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.94 
 
 
520 aa  427  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.96 
 
 
489 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.28 
 
 
509 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.847898  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.93 
 
 
490 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.54 
 
 
495 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.33 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  48.81 
 
 
490 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.63 
 
 
512 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.73 
 
 
471 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.93 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0358  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.05 
 
 
509 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.02 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.02 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  47.82 
 
 
496 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47 
 
 
477 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50 
 
 
496 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594754  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 
497 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.71 
 
 
502 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.82 
 
 
497 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.63 
 
 
516 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.46 
 
 
486 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.56 
 
 
474 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.35 
 
 
497 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.17 
 
 
501 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452647 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.06 
 
 
514 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2829  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.47 
 
 
478 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.65 
 
 
511 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.49 
 
 
488 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.26 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.26 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.92 
 
 
492 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
477 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.17 
 
 
500 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4418  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.18 
 
 
496 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1748  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  44.7 
 
 
488 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630432  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.17 
 
 
532 aa  352  8e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116947  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.84 
 
 
515 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  0.820801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14360  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.85 
 
 
507 aa  350  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.12 
 
 
500 aa  340  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.81 
 
 
478 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.49 
 
 
508 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.61 
 
 
469 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2417  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.95 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118165  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.29 
 
 
514 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259166  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0079  hypothetical protein  39.41 
 
 
479 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.28 
 
 
521 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3362  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.23 
 
 
489 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0212058  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.88 
 
 
498 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.7 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.44 
 
 
471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.15 
 
 
503 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.8 
 
 
471 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.97 
 
 
510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.46 
 
 
537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.56 
 
 
502 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.01 
 
 
533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  41.76 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  41.76 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  41.76 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.61 
 
 
517 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  41.76 
 
 
510 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.76 
 
 
510 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.92 
 
 
511 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.66 
 
 
500 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.11 
 
 
510 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5874  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.73 
 
 
498 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109065  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.46 
 
 
484 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.46 
 
 
484 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
513 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4920  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
513 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31782  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 
516 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.9 
 
 
511 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>