More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1396 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  98.32 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  93.24 
 
 		 298 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  93.24 
 
 		 298 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  93.24 
 
 		 298 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  90.27 
 
 		 298 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  89.6 
 
 		 298 aa  540  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  69.57 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  72.39 
 
 		 301 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  67.7 
 
 		 304 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  72.7 
 
 		 448 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  72.7 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  72.7 
 
 		 378 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  72.7 
 
 		 448 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  72.35 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  72.35 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  72.35 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  62.89 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  65.08 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 		 294 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  61.81 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  61.11 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  62.37 
 
 		 293 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  54.39 
 
 		 284 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  53.1 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  50.72 
 
 		 607 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  55.59 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 626 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  53.98 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  51.96 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  50.89 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  48.81 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  50.71 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  48.28 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  46.2 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.01 
 
 		 287 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.59 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 		 286 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  42.4 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  36.46 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.42 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.93 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.72 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  38.3 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  36.5 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  36.12 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  35.89 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  36.47 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  31.56 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  37.14 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.51 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.94 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  26.42 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  21.48 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  37.4 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  24.55 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>