More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1107 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  98.45 
 
 
386 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  98.45 
 
 
386 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  98.19 
 
 
386 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  97.48 
 
 
436 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  98.45 
 
 
386 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  98.45 
 
 
386 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
436 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  98.45 
 
 
386 aa  761    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  81.91 
 
 
383 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  80.62 
 
 
385 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  81.91 
 
 
383 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  79.74 
 
 
389 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  80.62 
 
 
385 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  81.65 
 
 
383 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  80.1 
 
 
383 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  80 
 
 
389 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  78.46 
 
 
389 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  64.23 
 
 
395 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  69.78 
 
 
402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  62.69 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  56.34 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  54.04 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  52.97 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  56.5 
 
 
393 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  57.52 
 
 
403 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  52.93 
 
 
400 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  53.17 
 
 
400 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.33 
 
 
408 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 
391 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  53.43 
 
 
352 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.1 
 
 
409 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  49.37 
 
 
389 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  48.11 
 
 
389 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.78 
 
 
383 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.27 
 
 
414 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.09 
 
 
422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.39 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  46.62 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.27 
 
 
386 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  45.18 
 
 
386 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.13 
 
 
381 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.94 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.17 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.94 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  47.85 
 
 
387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45.89 
 
 
397 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  46.13 
 
 
397 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.06 
 
 
397 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  46.46 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.92 
 
 
378 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  46.57 
 
 
398 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  46.31 
 
 
386 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.27 
 
 
384 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.25 
 
 
397 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.87 
 
 
383 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.78 
 
 
384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.78 
 
 
384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.78 
 
 
384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.94 
 
 
397 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  46.31 
 
 
386 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  46.31 
 
 
386 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  49.62 
 
 
390 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  45.8 
 
 
386 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  46.87 
 
 
383 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.8 
 
 
386 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.35 
 
 
399 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  50 
 
 
390 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  50.26 
 
 
390 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.64 
 
 
383 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.35 
 
 
399 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.5 
 
 
381 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.34 
 
 
445 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46 
 
 
381 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  48.87 
 
 
390 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.29 
 
 
384 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  46.14 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  45.91 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  45.91 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  45.67 
 
 
430 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  45.67 
 
 
430 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.04 
 
 
384 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.36 
 
 
391 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  45.67 
 
 
430 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  46.73 
 
 
390 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  45.43 
 
 
412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  44.95 
 
 
388 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  48.93 
 
 
390 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.4 
 
 
390 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.4 
 
 
390 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.31 
 
 
384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>