67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0067 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  98.95 
 
 		 287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  81.79 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2103  lytic transglycosylase, catalytic  73.45 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0550  lytic transglycosylase, catalytic  63.91 
 
 		 164 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  55.08 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2611  Lytic transglycosylase catalytic  61.54 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2871  Lytic transglycosylase catalytic  61.54 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  53.72 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  56.88 
 
 		 150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  56.88 
 
 		 150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  58.72 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1037  lytic transglycosylase, catalytic  52.89 
 
 		 156 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  53.72 
 
 		 165 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 		 150 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  58.93 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  41.77 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  54.78 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  57.14 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  47.22 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  49.5 
 
 		 158 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  56.64 
 
 		 342 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 206 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  48.96 
 
 		 175 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  49.48 
 
 		 197 aa  85.5  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  55.96 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  42.72 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.51 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.4 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  44.21 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  32.74 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  34.65 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  36.08 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  31 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  40.26 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  34.91 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  33.67 
 
 		 196 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  32.54 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  34.31 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  34.02 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  32.54 
 
 		 204 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 207 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  32 
 
 		 202 aa  45.8  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.78 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4128  lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 		 603 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5136  lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5146  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 228 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00474071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3221  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 228 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  29.91 
 
 		 241 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 669 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>