More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5138 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  100 
 
 		 495 aa  1009    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  51.33 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  48.98 
 
 		 544 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  47.75 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  44.74 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.74 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  43.85 
 
 		 528 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  43.62 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.03 
 
 		 532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  43.97 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.01 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  43.64 
 
 		 558 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  42.53 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  42.62 
 
 		 527 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  40.99 
 
 		 529 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.61 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 529 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  39.34 
 
 		 529 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  39.55 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 537 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  37.96 
 
 		 531 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  39.27 
 
 		 537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  39.34 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2913  extracellular solute-binding protein family 5  38.4 
 
 		 533 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.037834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  37.63 
 
 		 522 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 		 527 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 516 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  38.94 
 
 		 534 aa  316  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  38.93 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.55 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  36.31 
 
 		 560 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 522 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  38.11 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.12 
 
 		 532 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 528 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 536 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6559  extracellular solute-binding protein family 5  35.93 
 
 		 536 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67626  normal  0.403463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4327  putative ABC transporter, extracellular substrate binding protein  35.73 
 
 		 538 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 535 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 535 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1041  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 538 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  33.94 
 
 		 534 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  35.17 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2918  extracellular solute-binding protein family 5  35.76 
 
 		 538 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1152  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  35.7 
 
 		 530 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 		 532 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2972  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6144  extracellular solute-binding protein family 5  35.06 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.5133  hitchhiker  0.00348679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3082  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.49552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 539 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4290  extracellular solute-binding protein  33.54 
 
 		 530 aa  252  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00787986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  32.14 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  31.56 
 
 		 540 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.14 
 
 		 538 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 534 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 551 aa  203  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 565 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 540 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.3 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.3 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 528 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.73 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.84 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1611  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 		 259 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  30.69 
 
 		 502 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 521 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.8 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.66 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 		 563 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.95 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.17 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.48 
 
 		 508 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  30.11 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.17 
 
 		 535 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.2 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.67 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.82 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.67 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.67 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.67 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>