More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1576 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1576  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1072  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  4.69738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.6 
 
 
549 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
663 aa  185  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  21.41 
 
 
521 aa  84  6e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  26.71 
 
 
324 aa  83.6  8e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 
322 aa  82  3e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 
321 aa  79.7  1e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 
417 aa  77  7e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 
432 aa  76.6  1e-12  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 
424 aa  75.9  2e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.4 
 
 
350 aa  75.1  3e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 
415 aa  73.9  7e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  25.81 
 
 
380 aa  71.6  3e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1945  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 
322 aa  71.6  3e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  24.55 
 
 
311 aa  71.2  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.87759e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  27.65 
 
 
418 aa  71.6  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 
419 aa  70.5  6e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 
369 aa  70.1  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.87 
 
 
421 aa  69.7  1e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 
369 aa  70.1  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.22351e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 
357 aa  68.2  4e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  26.81 
 
 
419 aa  68.2  4e-10  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 
369 aa  68.2  4e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.18856e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  23.18 
 
 
369 aa  67.8  5e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.84298e-06  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  22.48 
 
 
621 aa  67.8  5e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.68 
 
 
607 aa  67.4  6e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 
417 aa  67.4  6e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  20.4 
 
 
366 aa  67  8e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 
413 aa  66.6  9e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.58 
 
 
375 aa  67  9e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  22.77 
 
 
399 aa  67  9e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  7.56014e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 
335 aa  66.2  1e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1295  efflux protein  25.29 
 
 
405 aa  66.2  1e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 
354 aa  66.2  1e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  25.08 
 
 
491 aa  66.2  1e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 
335 aa  66.2  1e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  24.89 
 
 
546 aa  65.9  2e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  23.01 
 
 
529 aa  65.5  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  21.53 
 
 
340 aa  65.9  2e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 
372 aa  65.5  3e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  22.49 
 
 
370 aa  65.1  3e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  25 
 
 
376 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0815  RND family efflux transporter MFP subunit  22.3 
 
 
359 aa  65.1  3e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.60919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 
352 aa  65.1  3e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 
387 aa  64.7  4e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.57 
 
 
360 aa  65.1  4e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  19.54 
 
 
376 aa  64.7  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 
380 aa  64.3  5e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  23.74 
 
 
401 aa  64.3  5e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  22.4 
 
 
352 aa  63.9  6e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.66929e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4493  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.35 
 
 
367 aa  64.3  6e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 
370 aa  63.9  7e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  23.08 
 
 
369 aa  63.9  7e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.12 
 
 
354 aa  63.9  7e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  23.74 
 
 
401 aa  63.9  7e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.30358e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 
435 aa  63.9  7e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  23.74 
 
 
401 aa  63.9  7e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.26253e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  22.65 
 
 
467 aa  63.5  8e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 
373 aa  63.5  8e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.35121e-05  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  27.31 
 
 
421 aa  63.5  9e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.86 
 
 
352 aa  63.2  1e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  23.31 
 
 
411 aa  63.2  1e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.38 
 
 
392 aa  62.4  2e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  24.45 
 
 
363 aa  62.4  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 
393 aa  62  2e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  23.02 
 
 
402 aa  62.4  2e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.83 
 
 
509 aa  62.8  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 
455 aa  62.8  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  23.18 
 
 
370 aa  62  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 
448 aa  62  2e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 
415 aa  62.4  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 
379 aa  62  3e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  24.79 
 
 
403 aa  62  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.67095e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  20.38 
 
 
378 aa  62  3e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 
358 aa  61.6  3e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  23.41 
 
 
459 aa  61.6  3e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 
358 aa  61.2  4e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 
429 aa  61.2  4e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.68 
 
 
354 aa  61.2  4e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  22.22 
 
 
406 aa  61.2  4e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 
478 aa  61.6  4e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.86 
 
 
608 aa  61.2  5e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0495  secretion protein HlyD  22.02 
 
 
323 aa  60.8  5e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.61 
 
 
368 aa  60.8  5e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.12 
 
 
354 aa  60.8  6e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 
368 aa  60.8  6e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  20.32 
 
 
359 aa  60.8  6e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 
505 aa  60.5  8e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  22.42 
 
 
395 aa  60.5  8e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  24.68 
 
 
455 aa  60.1  9e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  1.23833e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  24.68 
 
 
629 aa  60.1  9e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 
429 aa  60.1  1e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  22.52 
 
 
382 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  23.79 
 
 
456 aa  59.7  1e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 
621 aa  60.1  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  24.34 
 
 
533 aa  60.1  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  21.43 
 
 
390 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 
414 aa  60.1  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  21.86 
 
 
390 aa  60.1  1e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  7.2673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  22.52 
 
 
410 aa  60.1  1e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>