More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1128 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
350 aa  708  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  88.86 
 
 
350 aa  604  1e-172  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  88.57 
 
 
350 aa  603  1e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  88.29 
 
 
350 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  51.44 
 
 
354 aa  324  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  48.71 
 
 
339 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.42 
 
 
339 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.42 
 
 
340 aa  320  2e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  47.86 
 
 
340 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 
340 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.67 
 
 
339 aa  312  6e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  47.32 
 
 
357 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  46.38 
 
 
359 aa  305  9e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  47.03 
 
 
348 aa  304  1e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  45.92 
 
 
354 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  45.93 
 
 
343 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.49218e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  46 
 
 
354 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  45.69 
 
 
355 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  45.69 
 
 
355 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  45.69 
 
 
355 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  9.60348e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.71 
 
 
355 aa  298  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  45.69 
 
 
380 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  45.63 
 
 
354 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  46.84 
 
 
354 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  46.26 
 
 
354 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  46.55 
 
 
354 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 
352 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 
350 aa  295  7e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 
354 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  45.35 
 
 
354 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
354 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 
354 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  45.01 
 
 
354 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  47.14 
 
 
351 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 
355 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 
354 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 
354 aa  292  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 
355 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 
367 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
354 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
354 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  291  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  9e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  45.11 
 
 
357 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
354 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  48 
 
 
355 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 
354 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  46.55 
 
 
364 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 
354 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 
348 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 
352 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
355 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 
354 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  45.95 
 
 
340 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  44.77 
 
 
340 aa  289  5e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  47.43 
 
 
355 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 
345 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  46.81 
 
 
367 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 
345 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 
359 aa  288  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  42.54 
 
 
354 aa  288  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  47.44 
 
 
355 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  41.45 
 
 
357 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 
354 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  43.39 
 
 
365 aa  285  7e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  44.83 
 
 
360 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  45.38 
 
 
354 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 
345 aa  285  1e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 
355 aa  284  1e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 
360 aa  283  2e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 
356 aa  283  3e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 
348 aa  283  3e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  43.54 
 
 
355 aa  283  3e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 
345 aa  283  4e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 
356 aa  282  5e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.58 
 
 
354 aa  282  5e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  43.91 
 
 
353 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  45.98 
 
 
364 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.25 
 
 
354 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  42.25 
 
 
354 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  43.59 
 
 
355 aa  280  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  45.33 
 
 
392 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  42.54 
 
 
354 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
354 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 
354 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.63 
 
 
354 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>