215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1552 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
386 aa  762    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 
388 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  46.59 
 
 
405 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  38.32 
 
 
386 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  43.82 
 
 
390 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  37.54 
 
 
387 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  36.34 
 
 
432 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
381 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
378 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
389 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  33.89 
 
 
441 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  36.8 
 
 
383 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
402 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  34.94 
 
 
383 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  36.61 
 
 
383 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  35.14 
 
 
383 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
377 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 
389 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
383 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.38 
 
 
417 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
369 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
391 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.2 
 
 
403 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  34.26 
 
 
398 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 
379 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  32.25 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  31.83 
 
 
396 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  34.03 
 
 
400 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
391 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  35.74 
 
 
382 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  33.88 
 
 
384 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  33.88 
 
 
384 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  28.73 
 
 
384 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  33.88 
 
 
384 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
386 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
387 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  31.56 
 
 
384 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.39 
 
 
383 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  32.12 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  31.59 
 
 
385 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
405 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  33.62 
 
 
388 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  29.23 
 
 
397 aa  149  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  33.05 
 
 
384 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  32.3 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.97 
 
 
419 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  28.74 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
392 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  33.62 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  33.88 
 
 
392 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  30.77 
 
 
385 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  30.77 
 
 
385 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  31.1 
 
 
401 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  32.11 
 
 
373 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  29.01 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  28.18 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  29.82 
 
 
405 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  29.82 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  28.88 
 
 
404 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  28.88 
 
 
404 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
407 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  29.83 
 
 
402 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  29.97 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.23 
 
 
409 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
400 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
394 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  29.62 
 
 
439 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
397 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
384 aa  136  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.76 
 
 
451 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  29.55 
 
 
402 aa  135  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  30.3 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  27.51 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  29.71 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
425 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  29.43 
 
 
403 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  30.77 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  29.71 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  30.97 
 
 
389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  29.43 
 
 
403 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  29.43 
 
 
403 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  29.18 
 
 
414 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  29.81 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>