299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2889 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  62.86 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  59.13 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  53.74 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  52.53 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 236 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  53.67 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  35.47 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  31.71 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  31.71 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  27.83 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  33.48 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  45.71 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  41.18 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  46.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  50.85 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  50.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  50.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.66 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  38.61 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50.91 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  42.86 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>