232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0184 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  530  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  51.94 
 
 		 259 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  50 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  44.7 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  38.58 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  31.09 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  35.29 
 
 		 265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  35.52 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  34.94 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  34.2 
 
 		 281 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  30.35 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  33.77 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  29.17 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  23.98 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  23.98 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  30.77 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  25.9 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  27.31 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  23.48 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  25.9 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  30.1 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  24.73 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0132  aminotransferase, class IV  28.63 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  24.11 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  32.8 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  25 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  25.62 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  26.38 
 
 		 588 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  24.63 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  25.49 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  26.85 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  28.57 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01770  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.62 
 
 		 389 aa  53.1  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.41 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  25.2 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.41 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  25.6 
 
 		 296 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  23.08 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  33.05 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  23.01 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  25.4 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  28.64 
 
 		 629 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  22.61 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  22.08 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  22.87 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.81 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  22.46 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  23.13 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  29.44 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.64 
 
 		 607 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.39 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  24.15 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  24.17 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  25 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  23.86 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  27.84 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  26.54 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  21.65 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  29.92 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  26.27 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  22.91 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  23.89 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  24.51 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  27.42 
 
 		 284 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  26.07 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.39 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  25.47 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  29.91 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.36 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.07 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  22.03 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  31.9 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.32 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  25.32 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  22.82 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  29.1 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  30.77 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.32 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2045  aminotransferase class IV  23.56 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  hitchhiker  0.00531754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.41 
 
 		 632 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.93 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  23.85 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.32 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  25.21 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  27.61 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  26.58 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  26.36 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  25.81 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>