72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2963 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  61.24 
 
 		 283 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  57.79 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  57.36 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  54.13 
 
 		 272 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  37.61 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  34.75 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  29.96 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  32.7 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  36.28 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  32.95 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  28.71 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.01 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  30.71 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  31.92 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  29.17 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  27.05 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  31.42 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.59 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6961  aminotransferase class IV  24.19 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  23.79 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.27 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  29.2 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.27 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  26.89 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  27.73 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1085  aminotransferase class IV  27.78 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0132  aminotransferase, class IV  27.08 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  32.35 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  25 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  29.22 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  24.63 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.63 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  25.79 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  30.19 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  23.86 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.9 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.01 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  22.69 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  26.14 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.11 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.99 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  26.57 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.99 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  28.78 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.99 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  25.69 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.75 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  28.86 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.93 
 
 		 615 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  24.81 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  26.34 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  24.81 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  29.11 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  23.77 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  24.14 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  28.33 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  30.56 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  21.4 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  27.5 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  27.65 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.4 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>