49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4101 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  65.12 
 
 		 283 aa  341  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  57.79 
 
 		 283 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  54.69 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  55.6 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  35.32 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  35.77 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  33.92 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  34.07 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  34.3 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.5 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  34.51 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  32.95 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  28.43 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  27.27 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  26.04 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1085  aminotransferase class IV  27.83 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  24.6 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  27.45 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  24.37 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.52 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 303 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  23.64 
 
 		 741 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  31.54 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.85 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  30.66 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1919  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  27.27 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  30.77 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  24.47 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  25.86 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.03 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  28.21 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  25.38 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  26.75 
 
 		 283 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  33.33 
 
 		 296 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>