More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01770 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01770  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 389 aa  795    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  33.16 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  28.94 
 
 		 302 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  28.21 
 
 		 308 aa  123  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.29 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  26.36 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  26.63 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  27.39 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  36.99 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  26.85 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  25.52 
 
 		 308 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  25.52 
 
 		 308 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.91 
 
 		 308 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  25.52 
 
 		 308 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  25.26 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  27.89 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  26.17 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  24.87 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  26.02 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  25.88 
 
 		 302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  24.49 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  29.84 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  24.23 
 
 		 312 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  25.5 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  29.84 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  24.23 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  24.81 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 		 310 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  25.58 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  30.23 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  32.32 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  24.74 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  24.68 
 
 		 308 aa  109  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  27.21 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 		 309 aa  109  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  25.63 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  27.61 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  30.16 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  26.42 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  26.19 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.52 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  26.8 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  27.53 
 
 		 316 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 306 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  24.94 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  23.16 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 307 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  26.33 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.7 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  25.84 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  24.05 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  28.49 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  29.84 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  24.87 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  25.45 
 
 		 307 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  24.87 
 
 		 306 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  26.68 
 
 		 304 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 		 303 aa  103  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  25.59 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  29.67 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  25 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  24.94 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  23.53 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  27.18 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  26.62 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  29.67 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 		 307 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 304 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>