54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0994 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  537  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  66.41 
 
 		 283 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  65.93 
 
 		 271 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  55.6 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  53.28 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  33.46 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  41.15 
 
 		 265 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  33.88 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  36.72 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  33.77 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  37.75 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  35.51 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  37.13 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  34.09 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  25.21 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  26.54 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  25.83 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  30.3 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  23.79 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.46 
 
 		 741 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.29 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.87 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43558  predicted protein  26.11 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0165019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  27.11 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.87 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1085  aminotransferase class IV  27.4 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.1 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  25.48 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  31.66 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  21.88 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  25.87 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  22.04 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.11 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  25.48 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  23.79 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 269 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.94 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  24.71 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.23 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  25.13 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>