More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2479 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  80.44 
 
 
492 aa  776    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  96.2 
 
 
500 aa  930    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
496 aa  988    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  96 
 
 
500 aa  928    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  55.24 
 
 
395 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
382 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
390 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
382 aa  253  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
381 aa  250  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
373 aa  242  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 
388 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  38.48 
 
 
386 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
385 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
385 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
413 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
385 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
376 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
413 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 
392 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
413 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
413 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  31.88 
 
 
413 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2224  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
413 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175364  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1694  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
412 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
385 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
413 aa  177  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
378 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2494  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
413 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.207468  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
387 aa  170  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.93 
 
 
423 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0945  sarcosine oxidase beta subunit family protein  33.87 
 
 
418 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943396  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0998  sarcosine oxidase beta subunit family protein  32.03 
 
 
416 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  32.46 
 
 
457 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18810  sarcosine oxidase, beta subunit family, heterotetrameric form  32.08 
 
 
412 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3856  sarcosine oxidase subunit beta  32.6 
 
 
408 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.014492  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  31.61 
 
 
417 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.12 
 
 
414 aa  160  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.08 
 
 
431 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.05 
 
 
415 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4131  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.25 
 
 
416 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0445173  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2478  sarcosine oxidase, beta subunit  30.65 
 
 
416 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4032  sarcosine oxidase, beta subunit  30.65 
 
 
416 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.77 
 
 
415 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  30.77 
 
 
415 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  34.52 
 
 
822 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7233  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.95 
 
 
416 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0553602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
399 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.95 
 
 
406 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.21 
 
 
406 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2883  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.69 
 
 
419 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723496  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
397 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
376 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5635  sarcosine oxidase, beta subunit family  31.48 
 
 
416 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.99 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
799 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
374 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
984 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0992  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.79 
 
 
417 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
983 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2760  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.91 
 
 
417 aa  147  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0869  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.75 
 
 
417 aa  146  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
385 aa  146  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5048  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.65 
 
 
414 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.275422  normal  0.249273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0591  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.73 
 
 
417 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3991  sarcosine oxidase, beta subunit family  29.7 
 
 
417 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6204  sarcosine oxidase subunit beta  29.86 
 
 
416 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3736  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.27 
 
 
417 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.42969  normal  0.377029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
819 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71470  sarcosine oxidase beta subunit  29.86 
 
 
416 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115673  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1168  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
372 aa  143  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.754644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4031  sarcosine oxidase, beta subunit family  31.01 
 
 
417 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  29.12 
 
 
416 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3661  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.67 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616865  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2266  putative sarcosine oxidase, beta subunit  29.82 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0301  sarcosine oxidase beta subunit family protein  31.16 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3358  sarcosine oxidase, beta subunit family  30.67 
 
 
417 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
825 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4985  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
398 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4896  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
398 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1600  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  28.93 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.323345  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.82 
 
 
416 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
389 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_004310  BR0229  sarcosine oxidase, beta subunit  30.65 
 
 
417 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
398 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8584  sarcosine oxidase, beta subunit family  31.49 
 
 
417 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738598  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2147  sarcosine oxidase beta subunit family protein  32.07 
 
 
434 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
375 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4884  sarcosine oxidase beta subunit family protein  28.77 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.42 
 
 
416 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2117  sarcosine oxidase subunit beta  30.34 
 
 
417 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
816 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2366  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.77 
 
 
417 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5207  sarcosine oxidase, beta subunit, heterotetrameric  28.22 
 
 
416 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>