More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0057 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  60.06 
 
 		 646 aa  710    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 696 aa  1402    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.78 
 
 		 682 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.7 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 		 599 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.36 
 
 		 574 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 586 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 614 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  35.77 
 
 		 582 aa  332  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 		 582 aa  330  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  37.36 
 
 		 585 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 		 579 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.64 
 
 		 579 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  36.4 
 
 		 594 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  34.69 
 
 		 583 aa  319  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  36.58 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 601 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 582 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 		 593 aa  310  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  37.43 
 
 		 593 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  35.56 
 
 		 515 aa  307  4.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.62 
 
 		 597 aa  307  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  36.62 
 
 		 597 aa  307  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  35.96 
 
 		 584 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  36.15 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  37.57 
 
 		 597 aa  300  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 599 aa  296  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 597 aa  293  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 		 602 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 625 aa  290  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 625 aa  289  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  33.52 
 
 		 584 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 630 aa  283  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  34.69 
 
 		 595 aa  283  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  33.9 
 
 		 572 aa  280  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 		 600 aa  270  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 631 aa  240  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 		 662 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.87 
 
 		 656 aa  237  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 580 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.32 
 
 		 657 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.14 
 
 		 582 aa  231  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.23 
 
 		 660 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.5 
 
 		 657 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 582 aa  227  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 553 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 571 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 614 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 657 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 644 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  32.18 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 548 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  31.91 
 
 		 575 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 675 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  28.92 
 
 		 578 aa  221  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 588 aa  220  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  29.7 
 
 		 583 aa  220  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 582 aa  220  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  29.88 
 
 		 577 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  30.51 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 614 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.66 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.2 
 
 		 580 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.96 
 
 		 553 aa  218  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.08 
 
 		 582 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 		 672 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.55 
 
 		 710 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.89 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 		 570 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 		 576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 578 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 583 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 		 578 aa  213  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.95 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.14 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  31.13 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  29.41 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 705 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.68 
 
 		 695 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 582 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  28.85 
 
 		 708 aa  211  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.48 
 
 		 645 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 580 aa  209  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.78 
 
 		 553 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 587 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 587 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>