More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0035 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  54.65 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  48.75 
 
 
302 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
286 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
312 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 
294 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  44.17 
 
 
298 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  42.81 
 
 
323 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 
298 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.52 
 
 
287 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  43.11 
 
 
298 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 
293 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 
297 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  41.75 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  45.23 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  42.41 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  40.35 
 
 
304 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 
289 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  40.99 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
289 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
283 aa  191  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  43.96 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  38.46 
 
 
300 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
335 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  42.6 
 
 
325 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  38.46 
 
 
300 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  42.6 
 
 
421 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  42.49 
 
 
378 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  42.49 
 
 
448 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
311 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  42.49 
 
 
448 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  42.49 
 
 
448 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  42.49 
 
 
448 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  43.21 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 
292 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  39.19 
 
 
607 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
306 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  38.91 
 
 
626 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  39.64 
 
 
299 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  34.4 
 
 
284 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  37.87 
 
 
319 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  33.08 
 
 
283 aa  167  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
292 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
309 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
292 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  34.3 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 
295 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
302 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.91 
 
 
284 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
290 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  39.37 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
290 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
292 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  33.2 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  35.27 
 
 
274 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
274 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
299 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
298 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
290 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.54 
 
 
275 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  32.25 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
274 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  33.46 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  31.41 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.22 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
299 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.18 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  30.88 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  30.21 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
359 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  26.48 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
312 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>