122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3831 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 1141 aa  2325    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1176 aa  348  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1123 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1123 aa  322  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1162 aa  320  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1105 aa  300  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1173 aa  299  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 1232 aa  295  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.49 
 
 		 1194 aa  292  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1206 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1125 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1161 aa  283  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1153 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1075 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1149 aa  274  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.27 
 
 		 1203 aa  261  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1196 aa  257  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1124 aa  257  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1167 aa  255  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1065 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.24 
 
 		 1195 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1132 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1114 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.82 
 
 		 1298 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1257 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1105 aa  210  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1122 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.66 
 
 		 1162 aa  199  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1075 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  30.72 
 
 		 511 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  36.5 
 
 		 1210 aa  174  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1069 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1041 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.62 
 
 		 1125 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  30.99 
 
 		 986 aa  129  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  26.86 
 
 		 710 aa  125  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 1100 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  30.31 
 
 		 1071 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1067 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1052 aa  115  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1120 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1122 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1126 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1008 aa  112  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 1008 aa  111  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 1188 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1077 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1194 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1026 aa  108  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  32.73 
 
 		 992 aa  108  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  26.96 
 
 		 1056 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.7 
 
 		 966 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1109 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1068 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  24.29 
 
 		 1068 aa  103  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.61 
 
 		 1010 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1066 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1016 aa  99  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.49 
 
 		 1081 aa  97.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1074 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1053 aa  95.5  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  21.95 
 
 		 1041 aa  95.1  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 991 aa  94  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1054 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1097 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1074 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1066 aa  91.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.86 
 
 		 979 aa  91.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.93 
 
 		 1051 aa  89.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 972 aa  89.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 993 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1066 aa  85.9  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.7 
 
 		 1012 aa  82.8  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1105 aa  82.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1007 aa  82.4  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1129 aa  82  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.06 
 
 		 1061 aa  81.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1071 aa  81.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.3 
 
 		 1008 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.22 
 
 		 1037 aa  81.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  24.68 
 
 		 1057 aa  81.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.14 
 
 		 997 aa  80.1  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.35 
 
 		 1050 aa  79  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 1007 aa  77.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.29 
 
 		 994 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 871 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1008 aa  73.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 888 aa  72  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.76 
 
 		 1001 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.57 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1010 aa  65.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  23.49 
 
 		 1116 aa  65.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 988 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 1089 aa  59.3  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  22.86 
 
 		 782 aa  58.9  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 1087 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 952 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>