More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3432 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 315 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  50.68 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  50.34 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  46.92 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  46.76 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  47.25 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  49.82 
 
 		 297 aa  256  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  47.47 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  47.1 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  47.47 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  44.56 
 
 		 295 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  46.67 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.26 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  48.65 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  45.21 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.44 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  45.3 
 
 		 309 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  45.97 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  48.15 
 
 		 297 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47.46 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  46.91 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  48.06 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  44.05 
 
 		 300 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  48.5 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  49.15 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  45.92 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.02 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.64 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  46.94 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  42.81 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  46.34 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  48 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  47.87 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  41.9 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.33 
 
 		 296 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0120  polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 286 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  42.36 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45.59 
 
 		 294 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  46.59 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  47.33 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  47.4 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.29 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  45.42 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7389  Polyprenyl synthetase  45.68 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.49 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  40.48 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  44.8 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.11 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  44.64 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.56 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.48 
 
 		 293 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  47.33 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  47.6 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  49.12 
 
 		 297 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  43.11 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  44.96 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  42.52 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  48 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  40.14 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1126  polyprenyl synthetase  46.93 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.69 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  45.73 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  43.39 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0423  polyprenyl synthetase  46.79 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  40.51 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.4 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  43.33 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>