136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0910 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  100 
 
 		 1210 aa  2488    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 1153 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1173 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1124 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1176 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1123 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 1206 aa  331  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1123 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 1149 aa  281  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.77 
 
 		 1195 aa  278  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.7 
 
 		 1203 aa  274  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 1232 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1196 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 1105 aa  247  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1114 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1065 aa  226  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1162 aa  221  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 1105 aa  217  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1132 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1122 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  23.98 
 
 		 1194 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1194 aa  188  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1141 aa  179  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  32.07 
 
 		 511 aa  177  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1125 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  35.55 
 
 		 1075 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.45 
 
 		 1298 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1257 aa  167  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1075 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1167 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.97 
 
 		 1162 aa  161  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1069 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1161 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 1041 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  31.48 
 
 		 986 aa  147  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1067 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1100 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1097 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 1008 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1071 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1008 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1188 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  31.68 
 
 		 1125 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1066 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1074 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  29.01 
 
 		 979 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1122 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1052 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1126 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1053 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1120 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1077 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  26.81 
 
 		 1010 aa  101  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1068 aa  98.6  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1109 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  26.83 
 
 		 1068 aa  96.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1129 aa  95.5  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1026 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.3 
 
 		 1056 aa  93.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1054 aa  92  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.67 
 
 		 1041 aa  90.9  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.08 
 
 		 966 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1105 aa  90.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.58 
 
 		 1050 aa  87  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1010 aa  85.1  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 972 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 991 aa  83.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  22.6 
 
 		 1081 aa  83.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.25 
 
 		 1008 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.26 
 
 		 710 aa  82.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1074 aa  80.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 888 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.85 
 
 		 992 aa  78.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1071 aa  78.2  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  24.28 
 
 		 1051 aa  77.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.67 
 
 		 1066 aa  77  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1066 aa  77.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  24.23 
 
 		 1057 aa  76.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1016 aa  73.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 749 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.1 
 
 		 1001 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.12 
 
 		 1061 aa  69.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  26.58 
 
 		 1012 aa  68.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  21.97 
 
 		 997 aa  67.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 		 1116 aa  67.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1066 aa  67  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  23.94 
 
 		 782 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.39 
 
 		 1037 aa  62.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 952 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 897 aa  61.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.51 
 
 		 994 aa  58.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1066 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 924 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1008 aa  55.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  21.32 
 
 		 1007 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1007 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 988 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>