More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2327 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  100 
 
 
334 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  74.93 
 
 
339 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  43.96 
 
 
311 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  43.56 
 
 
313 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  46.88 
 
 
310 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
313 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  42.7 
 
 
337 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.65 
 
 
319 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  42.81 
 
 
319 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  38.08 
 
 
346 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  41.46 
 
 
297 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  38.89 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  38.92 
 
 
299 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  40.86 
 
 
314 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40.15 
 
 
326 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  39.7 
 
 
324 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  34.28 
 
 
310 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  34.57 
 
 
299 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  40.32 
 
 
331 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  33.33 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  35.22 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  40.14 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  38.19 
 
 
300 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  32.52 
 
 
312 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  29.23 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  34.98 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  37.55 
 
 
329 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  36.8 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  32.59 
 
 
313 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  32.7 
 
 
301 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  32.84 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  34.81 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  36.01 
 
 
320 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  32.49 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  32.49 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  32.49 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  34.95 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  37.5 
 
 
333 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.11 
 
 
281 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  28.11 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.14 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  25.26 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  25.26 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  25.26 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  27.1 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  24.67 
 
 
334 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  30.85 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  25.08 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  25.78 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.53 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.28 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  25.74 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  26.76 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  28.08 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  26.95 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  25.8 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  27.53 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.89 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  26.06 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  26.06 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  27.09 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  28.39 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  26.55 
 
 
274 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  26.64 
 
 
286 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  26.19 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  25.08 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.68 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  25.91 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  26.97 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  24.2 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  23.72 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  26.13 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  26.92 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  26.52 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  24.43 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2322  thioredoxin domain-containing protein  29.89 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000013282  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  27.81 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  27.56 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2442  thioredoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000180145  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  37.38 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.81 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  33.64 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  26.07 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2250  thioredoxin domain-containing protein  36.54 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000378794  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.89 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2017  thioredoxin-like protein  36.54 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  25.94 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  24.91 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1799  Thioredoxin domain protein  38.46 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.635888  hitchhiker  0.000000415158 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  25.24 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  36.89 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  24.92 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  25 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  25.53 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2547  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00617037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2585  thioredoxin domain-containing protein  38.46 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000251345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  37.14 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>