More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1223 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
890 aa  1817    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.7 
 
 
932 aa  656    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  38.6 
 
 
943 aa  635  1e-180  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  38.63 
 
 
939 aa  624  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  38.85 
 
 
955 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  39.22 
 
 
946 aa  615  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.46 
 
 
944 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  38.61 
 
 
954 aa  614  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.51 
 
 
972 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  37.38 
 
 
903 aa  586  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 
909 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  36.98 
 
 
898 aa  571  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.49 
 
 
928 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.39 
 
 
897 aa  558  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.16 
 
 
927 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.96 
 
 
903 aa  554  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.98 
 
 
937 aa  545  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.12 
 
 
928 aa  536  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.99 
 
 
970 aa  526  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.93 
 
 
916 aa  520  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 
916 aa  513  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
912 aa  485  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.62 
 
 
926 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
915 aa  466  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.46 
 
 
905 aa  462  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.49 
 
 
913 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
946 aa  439  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.24 
 
 
913 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  31.66 
 
 
1688 aa  357  5e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  32.19 
 
 
888 aa  351  4e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  37.82 
 
 
873 aa  340  7e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.04 
 
 
875 aa  337  5e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  35.44 
 
 
1435 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  36.59 
 
 
1388 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  30.76 
 
 
1480 aa  304  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  35.73 
 
 
874 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  34.29 
 
 
874 aa  304  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  28.39 
 
 
870 aa  302  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  35.9 
 
 
874 aa  302  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.39 
 
 
872 aa  300  6e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
900 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  34.68 
 
 
872 aa  298  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  36.41 
 
 
1419 aa  290  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  33.22 
 
 
922 aa  290  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.15 
 
 
1534 aa  288  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  33.44 
 
 
914 aa  285  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.92 
 
 
915 aa  284  6.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  28.54 
 
 
1495 aa  280  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  32.75 
 
 
1573 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.87 
 
 
1475 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.83 
 
 
1502 aa  278  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
1476 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 
1516 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
1553 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.46 
 
 
941 aa  273  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.05 
 
 
1480 aa  271  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  33.11 
 
 
1513 aa  268  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
1518 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
1505 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  32.1 
 
 
1604 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
1497 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  32.53 
 
 
1515 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 
1508 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.93 
 
 
1412 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 
1517 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
1523 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 
1381 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.33 
 
 
1538 aa  262  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.33 
 
 
1538 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  31.71 
 
 
1504 aa  261  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  31.74 
 
 
1544 aa  260  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  32.36 
 
 
1448 aa  260  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  32.33 
 
 
1538 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  32.33 
 
 
1538 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.33 
 
 
1525 aa  260  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  32.33 
 
 
1538 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  32.33 
 
 
1538 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.37 
 
 
1510 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  31.68 
 
 
1523 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
1523 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.33 
 
 
1514 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  32.65 
 
 
1493 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  32.36 
 
 
1448 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 
1539 aa  257  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  32.17 
 
 
1523 aa  257  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.51 
 
 
706 aa  256  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.99 
 
 
1538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  30.72 
 
 
1536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  31.23 
 
 
1536 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  31.23 
 
 
1536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.03 
 
 
701 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 
1429 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  32.2 
 
 
1535 aa  253  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.33 
 
 
933 aa  253  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  32.65 
 
 
1599 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.48 
 
 
1626 aa  251  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
1426 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  30.9 
 
 
1434 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.65 
 
 
1598 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  32.65 
 
 
1598 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>