More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00044 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  100 
 
 
1202 aa  2500    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  33.46 
 
 
1198 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  34.94 
 
 
1127 aa  541  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  28.26 
 
 
972 aa  300  8e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  30.04 
 
 
900 aa  297  7e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  29.04 
 
 
715 aa  291  6e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.2 
 
 
1170 aa  277  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  26.84 
 
 
1184 aa  276  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  28.95 
 
 
701 aa  271  7e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  28.26 
 
 
1045 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  28.03 
 
 
1086 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  27.75 
 
 
806 aa  201  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  29.28 
 
 
707 aa  198  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28.43 
 
 
1277 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  33.63 
 
 
1132 aa  177  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  46.07 
 
 
985 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  30.63 
 
 
1359 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
1102 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  30.67 
 
 
849 aa  128  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 
842 aa  128  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12310  predicted protein  43.95 
 
 
140 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  41.57 
 
 
1159 aa  127  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
1261 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.04 
 
 
964 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
848 aa  125  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  31.48 
 
 
1112 aa  124  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  38.07 
 
 
1120 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
1090 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  38.07 
 
 
1120 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  29 
 
 
1086 aa  121  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.78 
 
 
1088 aa  121  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  29.07 
 
 
1209 aa  121  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  29.78 
 
 
1088 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  35.41 
 
 
1125 aa  120  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  31.98 
 
 
991 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
1110 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  28.69 
 
 
1597 aa  119  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
1050 aa  119  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.7 
 
 
1091 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  36.97 
 
 
1142 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  30.88 
 
 
1100 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
876 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.46 
 
 
959 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  29.03 
 
 
1161 aa  118  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.53 
 
 
1068 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.3 
 
 
1362 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  28.74 
 
 
1698 aa  117  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
1113 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.56 
 
 
1071 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
1029 aa  117  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.13 
 
 
1113 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.22 
 
 
1084 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  38.22 
 
 
1084 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
966 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  29.65 
 
 
896 aa  116  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 
1160 aa  116  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  37.43 
 
 
1062 aa  116  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  29.84 
 
 
1284 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  28.34 
 
 
777 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.65 
 
 
1386 aa  115  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.36 
 
 
1134 aa  115  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.61 
 
 
977 aa  115  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  40 
 
 
1394 aa  115  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
1164 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.25 
 
 
1250 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  38.54 
 
 
1069 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  38.54 
 
 
1069 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
1069 aa  114  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
1120 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
1155 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1091 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  38.12 
 
 
1154 aa  114  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 
1129 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.56 
 
 
1068 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.98 
 
 
1026 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  29.34 
 
 
1084 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.22 
 
 
982 aa  113  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
1074 aa  113  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  37.23 
 
 
1163 aa  112  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  30.19 
 
 
872 aa  112  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.98 
 
 
1078 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.76 
 
 
1143 aa  112  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.53 
 
 
1437 aa  112  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.88 
 
 
1110 aa  111  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  27.71 
 
 
1178 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1073 aa  111  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1068 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
1021 aa  111  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
1104 aa  111  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 
1118 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  29.51 
 
 
914 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 
1055 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27.22 
 
 
1088 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
1073 aa  111  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  28.34 
 
 
1077 aa  110  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 
1089 aa  110  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  29 
 
 
995 aa  110  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 
1246 aa  110  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
950 aa  110  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.48 
 
 
1150 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>