More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1759 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  501  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  98.75 
 
 
240 aa  497  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
246 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
247 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
248 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
246 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
246 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 
244 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
270 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  27.98 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  30 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 
243 aa  95.9  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.58 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
250 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  27.46 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  27.08 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  28.87 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.78 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  26.8 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  26.12 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.69 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.19 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.76 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
265 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  21.54 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  23.79 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.88 
 
 
277 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  22.55 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2633  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.83 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364215  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.44 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  30.7 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.53 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.73 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  21.63 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
272 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  23.81 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  24.29 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.14 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0496  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.58 
 
 
251 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  28.21 
 
 
251 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  0.0000000000470617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  28.57 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.76 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.67 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  21.58 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.92 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.22 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.17 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  24.39 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.97 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.91 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.89 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  0.0000000191957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.79 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00690  ketoreductase, putative  25.68 
 
 
361 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.24 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.76 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.04 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>