More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1708 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 250 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 247 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  42.4 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.02 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  25.2 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  27.31 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  32.72 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  28.34 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  28.51 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  28.81 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.84 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  25 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  25.51 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  26.21 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  23.51 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  31.28 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  25.82 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  27.86 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  25.82 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.44 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  28 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1341  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  25.13 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000246645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1209  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.57 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.55 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.21 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.6 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  28.27 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.35 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.95482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>