More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1648 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  26.42 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  30.34 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  27.62 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.52 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  32.34 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  32.14 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.91 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  26.78 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  22.67 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  28.35 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.2 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.87 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.57 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  24.7 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1341  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  23.65 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000246645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  24.5 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.59 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  24.29 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  23.48 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  23.43 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1239  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.91 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.526898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  23.43 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.82 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  23.43 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.98 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  27.35 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  23.69 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  22.89 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1192  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  24.32 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>