More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5089 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  85.94 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  80.92 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  79.77 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.98 
 
 		 253 aa  349  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.84 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  66.27 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  46.43 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.09 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 247 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  41.22 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  28.74 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  28.14 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  28.14 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  28.35 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  28.64 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.36 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  28.02 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  27.84 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  27.37 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  27.37 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  26.84 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.71 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  27.37 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  26.84 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  25.62 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  28.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  27.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  26.84 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  26.84 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  28.42 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  27 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  27.18 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  26.84 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  26.67 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>