More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2872 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
222 aa  460  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.5 
 
 
238 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
238 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
249 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
257 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
247 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
257 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0573631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2774  short chain dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
258 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  hitchhiker  0.000224975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1674  short chain dehydrogenase family protein  35.16 
 
 
247 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00108636  hitchhiker  0.000219096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  hitchhiker  0.000000443735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000108179  normal  0.0377265 
 
 
-
 
NC_002950  PG1221  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.58 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0083444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
256 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
255 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0196374  unclonable  0.0000000191957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0264369  hitchhiker  0.0000000000470617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0978937  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000349992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
247 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0183678  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1372  short chain dehydrogenase family protein  33.02 
 
 
274 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0570365 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
249 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
260 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1335  short chain dehydrogenase family protein  30.14 
 
 
247 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00551908  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
250 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  28.33 
 
 
249 aa  92  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 
261 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
289 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  28.89 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  29.65 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  28.89 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  28.89 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.51 
 
 
258 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
262 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  29.28 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  25.86 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  25.32 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.76 
 
 
247 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
262 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  25.32 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.45506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  27.16 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.99 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.240703 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  27.93 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0429  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.99 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  26.96 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  27.39 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.99 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.767614  hitchhiker  0.00534124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  26.48 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.05 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.8 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.25 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.66 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  27.68 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
262 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  27.4 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
344 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
249 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  26.79 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
256 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>