More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1188 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  94.81 
 
 
289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  66.09 
 
 
292 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  57.49 
 
 
250 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  54.44 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  54.44 
 
 
250 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  53.23 
 
 
249 aa  275  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  53.44 
 
 
251 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 
250 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
247 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
253 aa  225  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
249 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 
249 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  45 
 
 
249 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
249 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
245 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
260 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01994  short chain dehydrogenase  63.08 
 
 
130 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000979327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
259 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
256 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  33.89 
 
 
256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
246 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
265 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
247 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
264 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
257 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  32.29 
 
 
252 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
265 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
266 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
249 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
257 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
344 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
256 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
246 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
247 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.63 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  32.46 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a