More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2482 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.46 
 
 
249 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.54 
 
 
247 aa  329  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  71.54 
 
 
249 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  63.42 
 
 
247 aa  299  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.81 
 
 
252 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.53 
 
 
246 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
249 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  47.66 
 
 
255 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
250 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.71 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
246 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
246 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
246 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
243 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
254 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 
245 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
245 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
247 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
246 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
243 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
245 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
249 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
246 aa  105  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  28.99 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.62 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.12 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.36 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.95482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.5 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.44 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.75 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.23 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.04 
 
 
245 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  28.07 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  28.07 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  25.76 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
266 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.27 
 
 
245 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
257 aa  58.9  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  32.98 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  28.43 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.68 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.56 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  28.43 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  28.43 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6102  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0605001  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>