More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5663 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  500  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  55.78 
 
 
251 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
249 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
257 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  46.25 
 
 
256 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  46.25 
 
 
256 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  46.25 
 
 
256 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.97 
 
 
247 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  45.14 
 
 
260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
254 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  47.64 
 
 
255 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
254 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
253 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
249 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
246 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
252 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
256 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 
244 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
247 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
245 aa  168  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  42.8 
 
 
249 aa  168  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
246 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
243 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
246 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
243 aa  150  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
246 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
246 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
246 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
252 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
248 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
254 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  33.87 
 
 
240 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
245 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
243 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
246 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
243 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
244 aa  134  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
249 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
247 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
249 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
254 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
248 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
250 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
245 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
254 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.48 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  26.36 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  25.94 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.7 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  27.46 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.52 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.94 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.61 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0379321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1087  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  27.6 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>